轉錄組學
作者:lifeint   添加時間:2017-12-18 23:13:56   浏覽:

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實驗介紹

        

       外(wài)泌體(tǐ)RNA是一(yī)種具有重要生(shēng)物(wù)學功能的RNA,包括mRNA、miRNA、lncRNA等多種類型。外(wài)泌體(tǐ)RNA測序是通過對外(wài)泌體(tǐ)RNA的測序,來獲得RNA序列信息,從而對RNA進行分(fēn)析和研究。外(wài)泌體(tǐ)RNA測序技術已經被廣泛應用于癌症、神經退行性疾病、心血管疾病等多種疾病的研究中(zhōng)。外(wài)泌體(tǐ)RNA可以作爲一(yī)種重要的生(shēng)物(wù)标志(zhì)物(wù),爲疾病的診斷、治療和預後等方面提供了重要的科學依據。外(wài)泌體(tǐ)RNA測序技術服務項目通常包括外(wài)泌體(tǐ)RNA的提取、測序、數據分(fēn)析等多個環節。通過這些環節,研究人員(yuán)可以獲得外(wài)泌體(tǐ)RNA的全面信息,包括RNA表達水平、剪接變異、轉錄後修飾等信息,進而對RNA的功能進行分(fēn)析和研究。


1.  Small RNA測序

       Small RNA主要包含miRNA、piRNA、tsRNA和snoRNA等RNA分(fēn)子。小(xiǎo)RNA參與基因表達與調控、RNA的加工(gōng)與剪切、蛋白(bái)質翻譯、遺傳“入侵”抑制、配子發生(shēng)等重要生(shēng)物(wù)學過程,是生(shēng)命活動中(zhōng)不可少的調控因子。微小(xiǎo)RNA(microRNA,簡稱miRNA)是小(xiǎo)RNA的最主要部分(fēn),已被證明與包括癌症、心血管疾病、免疫系統疾病在内的多種疾病密切相關。此外(wài),外(wài)泌體(tǐ)miRNA也可以作爲疾病的生(shēng)物(wù)标志(zhì)物(wù),廣泛應用于疾病診斷、個性化治療和預後等領域。高通量測序技術可以在單次測序中(zhōng)獲得樣品中(zhōng)所有小(xiǎo)RNA的序列信息,從而分(fēn)析不同疾病狀态、不同樣品來源、不同處理條件下(xià)小(xiǎo)RNA的表達水平,并精确比較其之間的小(xiǎo)RNA表達差異,從而爲後續研究小(xiǎo)RNA的生(shēng)物(wù)學意義提供指引。

       當前實驗室采用基于QIAseq的建庫體(tǐ)系,最低1ng總RNA即可完成miRNA建庫,并且優化的反應化學可實現構建穩定的miRNA特異性文庫,最大(dà)限度地減少反應偏差并消除接頭二聚體(tǐ)。獨特的分(fēn)子标簽(UMI)在早期階段标記每個miRNA,消除了PCR和測序偏差,是目前外(wài)泌體(tǐ)樣品miRNA建庫相對數據質量較高的建庫方案。

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2.  非編碼RNA測序

       外(wài)泌體(tǐ)RNA特别是非編碼RNA,在不同的疾病模型中(zhōng)存在明顯的表達差異,有望成爲液體(tǐ)活檢的重要分(fēn)子标志(zhì)物(wù),并揭示疾病發生(shēng)的機理。利用高通量轉錄組測序技術可以同時檢測其所含RNA分(fēn)子如lncRNA、mRNA、circRNA,對外(wài)泌體(tǐ)非編碼RNA分(fēn)子鑒定和調控功能進行研究。

       當前實驗室采用基于SMARTer的建庫體(tǐ)系,最低1ng總RNA即可完成LncRNA建庫,後續測序數據可單獨進行LncRNA和mRNA分(fēn)析,也可以聯合miRNA測序數據進行全轉錄組分(fēn)析(包含LncRNA、mRNA、CircRNA、miRNA)。

34.jpg


檢測項目


服務序号

服務内容

服務說明

服務周期

1

RNA提取

采用外(wài)泌體(tǐ)專用微量RNA提取試劑盒提取RNA并檢測濃度,交付:XLSX格式RNA濃度數據

3個工(gōng)作日

2

RNA質控

采用毛細管電(diàn)泳的方法檢測核酸的片段分(fēn)布,儀器平台:Qsep100,交付:PDF格式樣品分(fēn)析報告,BOPX格式儀器原始數據

1個工(gōng)作日

3

miRNA測序

包含建庫質控、上機測序、标準分(fēn)析,采用微量建庫方案,Illumina平台PE150測序策略,數據産出10M reads(3G Rawdata),交付:miRNA HTML格式分(fēn)析報告,WORD格式文庫質控報告,FASTQ測序原始數據

20個工(gōng)作日

4

LncRNA測序

包含建庫質控、上機測序、标準分(fēn)析,采用微量建庫方案,Illumina平台PE150測序策略,數據産出10G Rawdata,交付:LncRNA\mRNA HTML格式分(fēn)析報告,WORD格式文庫質控報告,FASTQ測序原始數據

20個工(gōng)作日

5

全轉錄組測序

包含建庫質控、上機測序、标準分(fēn)析,采用微量建庫方案,Illumina平台PE150測序策略,數據産出13G Rawdata,交付:LncRNA\mRNA\CircRNA\miRNA HTML格式分(fēn)析報告,WORD格式文庫質控報告,FASTQ測序原始數據

20個工(gōng)作日


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微環DNA表達雙靶向抗體(tǐ)的癌症免疫治療技術成爲繼CAR-T技術(“嵌合抗原受體(tǐ)T細胞免疫療法”)、TIL技術(“腫瘤滲潤淋巴細胞技術)、免疫檢查點抑制劑等技術之後又(yòu)一(yī)項獲得成功的新一(yī)代治療技術。

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