蛋白(bái)組學
作者:lifeint   添加時間:2017-12-18 22:05:55   浏覽:

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實驗介紹

        

       外(wài)泌體(tǐ)是一(yī)種包裹着膜的細胞外(wài)囊泡,其中(zhōng)包含了許多生(shēng)物(wù)分(fēn)子,包括蛋白(bái)質、RNA、DNA等。外(wài)泌體(tǐ)蛋白(bái)質是外(wài)泌體(tǐ)的主要組成部分(fēn)之一(yī),研究外(wài)泌體(tǐ)蛋白(bái)質組學有助于深入了解外(wài)泌體(tǐ)的功能和在疾病中(zhōng)的作用。外(wài)泌體(tǐ)蛋白(bái)質組學研究可以通過多種方法進行,其中(zhōng)包括質譜分(fēn)析、免疫學檢測等。外(wài)泌體(tǐ)蛋白(bái)質組學研究可以爲研究人員(yuán)提供許多信息,包括外(wài)泌體(tǐ)的生(shēng)物(wù)合成、分(fēn)泌、細胞信号傳導、疾病發生(shēng)發展等方面的信息。外(wài)泌體(tǐ)蛋白(bái)質組學技術服務項目通常包括外(wài)泌體(tǐ)的提取、蛋白(bái)質的分(fēn)離(lí)、質譜分(fēn)析等多個環節。通過這些環節,研究人員(yuán)可以獲得外(wài)泌體(tǐ)蛋白(bái)質的全面信息,進而對外(wài)泌體(tǐ)蛋白(bái)質進行分(fēn)析和研究。


1.  Label-free非标記定量蛋白(bái)質組

       定量蛋白(bái)質組學是利用質譜平台檢測樣品中(zhōng)蛋白(bái)相對含量的分(fēn)析化學技術,非标(Label free)蛋白(bái)質組定量技術是一(yī)種不依賴于同位素标記的蛋白(bái)質定量技術,該技術通過液質聯用對蛋白(bái)質酶解肽段進行檢測,分(fēn)析大(dà)規模鑒定蛋白(bái)質時所産生(shēng)的質譜數據,對被檢測到的離(lí)子峰強度進行積分(fēn),以積分(fēn)面積進行相對定量。

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2.  TMT标記定量蛋白(bái)質組

       TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研發的一(yī)種多肽體(tǐ)外(wài)等重同位素标記的相對與絕對定量技術,采用6、10及16種同位素的标簽,通過特異性标記多肽的氨基基團,經高分(fēn)辨質譜儀串聯分(fēn)析,可同時比較多達16種樣品之間的蛋白(bái)質表達量,是定量蛋白(bái)質組學中(zhōng)的高通量篩選技術。

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3.  DIA定量蛋白(bái)質組

       數據非依賴型采集模式(Data-Independent Acquisition,DIA)逐漸嶄露頭角。相較于DDA數據采集模式在一(yī)級質譜中(zhōng)每個時間窗口采集響應值較高的有限肽段離(lí)子(通常是TOP20)進入二級質譜進行碎裂分(fēn)析。DIA将質譜整個全掃描範圍分(fēn)爲若幹個窗口,高速、循環地對每個窗口中(zhōng)的所有離(lí)子進行選擇、碎裂及檢測,從而無遺漏、無差異地獲得樣本中(zhōng)所有離(lí)子的全部碎片信息。

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4.  PRM靶向蛋白(bái)組

       平行反應監測(parallel Reaction Monitoring, PRM) 是一(yī)種基于Orbitrap爲代表的高分(fēn)辨、高精度質譜的離(lí)子監視技術,首先利用四級杆質量分(fēn)析器的選擇能力,用Q1選擇目标肽段的母離(lí)子,随後在collision cell 中(zhōng)對母離(lí)子進行碎裂, 最後利用Orbitrap分(fēn)析器在二級質譜中(zhōng)檢測所選擇的母離(lí)子窗口内的所有碎片信息。這樣能夠對目标蛋白(bái)質、目标肽段(如發生(shēng)翻譯後修飾的肽段)進行選擇性檢測,即可對目标蛋白(bái)質/肽段進行相對(絕對)定量。從而實現對複雜(zá)樣本中(zhōng)的目标蛋白(bái)質/肽段進行準确地特異性分(fēn)析。

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5.  宏蛋白(bái)組

       宏蛋白(bái)組學是應用蛋白(bái)質組學技術對微生(shēng)物(wù)群落進行研究的一(yī)項新技術,在特定的時間對微生(shēng)物(wù)群落的所有蛋白(bái)質的組成進行大(dà)規模的鑒定。宏蛋白(bái)組能夠提供微生(shēng)物(wù)在生(shēng)态系統中(zhōng)的功能信息,它有望把微生(shēng)物(wù)群落的遺傳和功能多樣性聯系起來,對于不同環境的宏蛋白(bái)組分(fēn)析可以捕捉新的功能基因和代謝途徑、鑒定與特異性脅迫有關的蛋白(bái),蛋白(bái)組學聯合宏基因組學數據可以更好的揭示環境群落分(fēn)類多樣性、功能多樣性和生(shēng)物(wù)過程。

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6.  PBA單囊泡膜蛋白(bái)組

       鄰近編碼技術(Proximity Barcoding Assay,PBA)使用微米大(dà)小(xiǎo)的單鏈DNA簇,每個簇具有數百個通過滾環擴增産生(shēng)特有的DNA拷貝序列,可對單個外(wài)泌體(tǐ)進行DNA編碼标記。樣本中(zhōng)單個外(wài)泌體(tǐ)的表面蛋白(bái)組成通過與之結合的抗體(tǐ)-DNA偶聯物(wù)可被轉化爲DNA序列信息,該偶聯物(wù)合并了每個滾環擴增産物(wù)中(zhōng)重複的随機編碼序列。通過PCR擴增後,利用新一(yī)代測序技術解析DNA序列中(zhōng)包含的蛋白(bái)和外(wài)泌體(tǐ)信息,以識别單個外(wài)泌體(tǐ)的表面蛋白(bái)組成。鄰近編碼技術可高通量地編碼标記樣本中(zhōng)所有單外(wài)泌體(tǐ)表面蛋白(bái),其檢測限度取決于蛋白(bái)結合特異性、測序的範圍和深度、以及抗體(tǐ)的親和力和選擇性。通過比較不同來源的外(wài)泌體(tǐ)圖譜,可找到特定的表面蛋白(bái)組合作爲生(shēng)物(wù)标記物(wù),用于識别和量化從健康和疾病的特定組織釋放(fàng)進入血液中(zhōng)的外(wài)泌體(tǐ)。

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檢測項目


服務序号

服務内容

服務說明

服務周期

1

Label-free非标記定量蛋白(bái)質組

采用Label-free非标記定量方法進行蛋白(bái)組學檢測并進行标準數據分(fēn)析,交付:DOCX格式報告,RAW格式機器原始數據

20個工(gōng)作日

2

TMT标記定量蛋白(bái)質組

采用TMT标記定量方法進行蛋白(bái)組學檢測并進行标準數據分(fēn)析,交付:DOCX格式報告,RAW格式機器原始數據

20個工(gōng)作日

3

DIA定量蛋白(bái)質組

采用DIA定量方法進行蛋白(bái)組學檢測并進行标準數據分(fēn)析,交付:DOCX格式報告,RAW格式機器原始數據

20個工(gōng)作日

4

PRM靶向蛋白(bái)組

采用PRM靶向定量方法進行蛋白(bái)組學檢測并進行标準數據分(fēn)析,交付:DOCX格式報告,RAW格式機器原始數據

20個工(gōng)作日

5

宏蛋白(bái)組

采用宏蛋白(bái)組方法進行蛋白(bái)組學檢測并進行标準數據分(fēn)析,交付:DOCX格式報告,RAW格式機器原始數據

30個工(gōng)作日

6

PBA單囊泡膜蛋白(bái)組

采用PBA單囊泡膜蛋白(bái)組進行膜蛋白(bái)組學檢測并進行标準數據分(fēn)析,交付:PDF格式報告,FASTQ機器原始數據

30個工(gōng)作日


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微環DNA表達雙靶向抗體(tǐ)的癌症免疫治療技術成爲繼CAR-T技術(“嵌合抗原受體(tǐ)T細胞免疫療法”)、TIL技術(“腫瘤滲潤淋巴細胞技術)、免疫檢查點抑制劑等技術之後又(yòu)一(yī)項獲得成功的新一(yī)代治療技術。

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